该方案要求，“头雁”行动实施按团队申报、以项目管理方式进行，采取“一事一议、按需支持”政策，赋予“头雁”人才充分自主权。“头雁”人才主要包括国家级高端人才或海外杰出人才，自然科学、工程科学类团队由5至10人组成，哲学社会科学类团队由3至5人组成。支撑平台包括重点实验室、工程研究中心、协同创新中心、临床医学重点专科、人文社科基地等国家级平台。依托学科应是具有国际或国内领先水平的学科，依托项目主要包括国家级和省部级重大基础研究、重大科技专项、重点研发计划等。
按照方案，“头雁”团队资金将按团队分期支持，每期5年，支持资金原则上一个建设期、一个团队最高可达5000万元，用于人才培养、队伍建设、创新平台建设、学术交流合作和团队运行与管理等。自然科学和工程技术类可将其中不超过50％、哲学社会科学类可以将其中不超过80％的支持经费用在培养、稳定和集聚高层次创新人才上。“头雁”团队骨干人才可以年薪制、协议工资制、项目工资、奖励津贴、生活补贴等方式享受薪酬待遇，其额度最高可达每人每年100万元。
黑龙江省教育厅相关负责人介绍，“头雁”团队创造成果优先在省内转化，所得收入原则上全部留归团队支配使用，团队自主制定奖励团队人员的激励措施。同时，“头雁”人才在科研用房、子女入学、医疗服务等相关保障方面享受优惠政策。